En el año de 1995 la Universidad Católica de Santiago de Guayaquil conjuntamente con la Universidad Católica de Lovaina – Bélgica firman un Convenio de Asistencia Técnica con el objetivo de crear el Instituto de Biomedicina, en ese entonces llamado Instituto de Biología Molecular y Tropical.  Se efectuó la construcción del edificio y se adquirió equipos especializados para dar inicio al desarrollo de investigación en el campo de la biología molecular.

En consideración al avance científico y la interrelación de las diferentes área de la salud se reinaugurado en noviembre del 2001 al Instituto de Biología Molecular y Tropical como el Instituto de Biomedicina.

Esta unidad sin fines de lucro y adscrita a la Facultad de Ciencias Médicas de la Universidad Católica de Santiago de Guayaquil, tiene por misión realizar investigación científica, implementación y desarrollo de nuevas tecnologías  a través de su laboratorio y personal especializado dentro de áreas específicas de la biomedicina y del  conocimiento; prestar servicios profesionales como medio para su autofinanciamiento y  realizar actualización o estudios continuos de postgrado, dar soporte a la educación de pregrado y colaborar con el Sistema de Postgrado de la Universidad. Es decir se manejará bajo tres parámetros bien definidos: investigación, docencia y venta de servicios.

Tendrá como visión el lograr posicionarse dentro de la investigación científica nacional  e internacional con liderazgo y excelencia académica.