El Instituto de Biomedicina tiene establecido los siguientes objetivos para el desarrollo de sus actividades:

A. Desarrollar ciencia y tecnología de alto nivel, contribuyendo de manera sustancial al desarrollo del país, bajo un criterio multiprofesional, interdisciplinario y bioético.

B. Aplicar conocimientos científicos y tecnológicos para el desarrollo de servicios orientados al fortalecimiento, modernización, y tecnificación de los procesos de salud, en el contexto de la realidad socio-económica del país.

C. Promover los procesos de investigación y desarrollo que se generen, estableciendo a partir de ellos su vinculación con el sector académico y productivo nacional.

D. Contribuir, a través de la producción de nuevos conocimientos, a la promoción de la salud y a la comprensión y solución de los principales problemas bio-patológicos de la sociedad ecuatoriana.

E. Fomentar la educación en el campo de la investigación, biomedicina, biotecnología, todo ello enmarcado en un estricto respeto a los principios éticos que rigen estos procesos.

F. Crear y mantener un centro de documentación e información.  

G. Fortalecer la cooperación con otros centros y organismos nacionales e internacionales, orientados a los mismos propósitos.

H. Brindar servicios científicos y biotecnológicos al sector público y privado, solventados en estándares de calidad y competitividad.

I. Dar soporte al desarrollo científico de la Facultad  de Ciencias Médicas a través de las líneas de investigación planteadas por la misma.

J. Brindar las facilidades a las demás facultades de la Universidad Católica para el desarrollo de proyectos de investigación.